주요 차이점은 rDNA 서열 내에서의 위치와 변이 속도(진화 속도)에 있습니다.
1. LSU (Large Subunit)
- 풀이: 대거대 하위 단위 (Large Subunit)
- 설명: 리보솜을 구성하는 두 개의 단위체 중 큰 쪽을 의미합니다. 진핵생물에서는 보통 28S rRNA (식물은 25S/26S) 유전자를 지칭합니다.
- 특징: 유전자 부위이기 때문에 변이 속도가 상대적으로 느립니다.
- 용도: 주로 과(Family)나 목(Order) 수준의 높은 분류 단계에서 계통 유전학적 관계를 파악할 때 사용됩니다.
2. ITS (Internal Transcribed Spacer)
- 풀이: 내부 전사 간격 부위 (Internal Transcribed Spacer)
- 설명: 리보솜 DNA 유전자들(SSU - 5.8S - LSU) 사이에 끼어 있는 비암호화(Non-coding) 영역입니다.
- ITS1: SSU(18S)와 5.8S 사이
- ITS2: 5.8S와 LSU(28S) 사이
- 특징: 유전자가 아닌 '간격' 부위이므로 돌연변이가 일어나도 생존에 큰 지장이 없어 변이 속도가 매우 빠릅니다.
- 용도: 종(Species) 수준의 식별에 가장 널리 쓰입니다. 특히 균류(버섯, 곰팡이)의 표준 DNA 바코드로 사용됩니다.
3. IGS (Intergenic Spacer)
- 풀이: 유전자 간 간격 부위 (Intergenic Spacer)
- 설명: 하나의 rDNA 단위(unit)와 다음 rDNA 단위 사이를 연결하는 더 넓은 비암호화 영역입니다. (NTS, Non-Transcribed Spacer라고도 불립니다.)
- 특징: ITS보다도 훨씬 더 길고 변이 속도가 가장 빠릅니다.
- 용도: 종 내부의 계통(Strain)이나 개체군(Population) 간의 미세한 차이를 구별할 때 주로 사용됩니다.
요약 비교표
| 구분 | LSU | ITS | IGS |
|---|---|---|---|
| 풀이 | Large Subunit | Internal Transcribed Spacer | Intergenic Spacer |
| 위치 | 리보솜 유전자 본체 (28S) | 유전자 사이의 좁은 간격 | 유전자 세트 사이의 넓은 간격 |
| 변이 속도 | 느림 (보존적임) | 빠름 | 매우 빠름 |
| 주요 용도 | 높은 분류군(과, 목) 연구 | 종(Species) 식별 (표준) | 종 내부 변이, 개체군 연구 |
구조적 순서 (진핵생물 rDNA)
보통 아래와 같은 순서로 반복되어 배열됩니다.
[SSU] - (ITS1) - [5.8S] - (ITS2) - [LSU] - {IGS} - [SSU] ... (반복)
- 대괄호 [ ]: 유전자 부위 (상대적으로 변하지 않음)
- 소괄호 ( ) / 중괄호 { }: 간격 부위 (변이가 많아 식별에 용이함)
참고: 만약 이 질문이 교통 시스템(ITS: Intelligent Transport Systems)이나 다른 IT 분야에 관한 것이라면 다시 말씀해 주세요. 분야에 따라 의미가 완전히 달라질 수 있습니다.